Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NCKAP1Q9Y2A7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NCKAP1Q9Y2A7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NCKAP1Q9Y2A7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms