Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMG5Q9UPR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMG5Q9UPR3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMG5Q9UPR3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMG5Q9UPR3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms