Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
L1RE1Q9UN81 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
L1RE1Q9UN81 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
L1RE1Q9UN81 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms