Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCDHA12Q9UN75 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHA12Q9UN75 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHA12Q9UN75 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHA12Q9UN75 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms