Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FZD4Q9ULV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FZD4Q9ULV1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FZD4Q9ULV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FZD4Q9ULV1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms