Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKLN1Q9UL63 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MKLN1Q9UL63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MKLN1Q9UL63 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms