Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PNMA3Q9UL41 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNMA3Q9UL41 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PNMA3Q9UL41 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PNMA3Q9UL41 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms