Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP45Q9UL16 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP45Q9UL16 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP45Q9UL16 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms