Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ3

GPATCH8, G patch domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH8Q9UKJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
GPATCH8Q9UKJ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
GPATCH8Q9UKJ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.02■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
GPATCH8Q9UKJ3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC37■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
GPATCH8Q9UKJ3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
GPATCH8Q9UKJ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms