Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CROTQ9UKG9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CROTQ9UKG9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CROTQ9UKG9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms