Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIMS3Q9UJD0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RIMS3Q9UJD0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIMS3Q9UJD0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIMS3Q9UJD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms