Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPN3Q9UHW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GPN3Q9UHW5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPN3Q9UHW5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms