Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LAMTOR3Q9UHA4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LAMTOR3Q9UHA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms