Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
APOBEC3BQ9UH17 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOBEC3BQ9UH17 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOBEC3BQ9UH17 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOBEC3BQ9UH17 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms