Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HMGXB4Q9UGU5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HMGXB4Q9UGU5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms