Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLIP2Q9UDT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLIP2Q9UDT6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms