Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NXF1Q9UBU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NXF1Q9UBU9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NXF1Q9UBU9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms