Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
UPB1Q9UBR1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
UPB1Q9UBR1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UPB1Q9UBR1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms