Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPASTQ9UBP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPASTQ9UBP0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPASTQ9UBP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms