Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRPC4Q9UBN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRPC4Q9UBN4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRPC4Q9UBN4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms