Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNTN3Q9P232 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNTN3Q9P232 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNTN3Q9P232 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNTN3Q9P232 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms