Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNIH4Q9P003 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNIH4Q9P003 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNIH4Q9P003 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms