Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYOFQ9NZM1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYOFQ9NZM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYOFQ9NZM1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms