Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RRN3Q9NYV6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RRN3Q9NYV6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRN3Q9NYV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRN3Q9NYV6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
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