Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY26

SLC39A1, Zinc transporter ZIP1, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A1Q9NY26 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC39A1Q9NY26 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC39A1Q9NY26 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A1Q9NY26 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms