Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM260Q9NX78 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM260Q9NX78 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM260Q9NX78 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM260Q9NX78 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms