Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERINC1Q9NRX5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SERINC1Q9NRX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SERINC1Q9NRX5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms