Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VPS45Q9NRW7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VPS45Q9NRW7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms