Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHL1Q9NR64 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KLHL1Q9NR64 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLHL1Q9NR64 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLHL1Q9NR64 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms