Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPCPD1Q9NPB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GPCPD1Q9NPB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPCPD1Q9NPB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GPCPD1Q9NPB8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GPCPD1Q9NPB8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms