Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN28AQ9H9Z2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LIN28AQ9H9Z2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LIN28AQ9H9Z2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms