Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL25Q9H0H3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL25Q9H0H3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL25Q9H0H3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms