Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0C3

TMEM117, Transmembrane protein 117, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM117Q9H0C3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMEM117Q9H0C3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TMEM117Q9H0C3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMEM117Q9H0C3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms