Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRNKL1Q9BZJ0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRNKL1Q9BZJ0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRNKL1Q9BZJ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms