Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD1Q9BXT4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TDRD1Q9BXT4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TDRD1Q9BXT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms