Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB1

LGR4, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR4Q9BXB1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LGR4Q9BXB1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LGR4Q9BXB1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LGR4Q9BXB1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LGR4Q9BXB1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms