Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRU9

UTP23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP23Q9BRU9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UTP23Q9BRU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
UTP23Q9BRU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UTP23Q9BRU9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms