Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR0

ZKSCAN3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN3Q9BRR0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZKSCAN3Q9BRR0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZKSCAN3Q9BRR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZKSCAN3Q9BRR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZKSCAN3Q9BRR0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms