Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TM2D3Q9BRN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TM2D3Q9BRN9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TM2D3Q9BRN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms