Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
FYCO1Q9BQS8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
FYCO1Q9BQS8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
FYCO1Q9BQS8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
FYCO1Q9BQS8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
FYCO1Q9BQS8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.3 ms