Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TCF25Q9BQ70 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TCF25Q9BQ70 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TCF25Q9BQ70 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TCF25Q9BQ70 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms