Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CDC6Q99741 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDC6Q99741 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDC6Q99741 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms