Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PSMD1Q99460 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PSMD1Q99460 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PSMD1Q99460 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PSMD1Q99460 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms