Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
CRAMP1Q96RY5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CRAMP1Q96RY5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CRAMP1Q96RY5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRAMP1Q96RY5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRAMP1Q96RY5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms