Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TGS1Q96RS0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TGS1Q96RS0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TGS1Q96RS0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms