Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCDC85AQ96PX6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCDC85AQ96PX6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCDC85AQ96PX6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC85AQ96PX6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC85AQ96PX6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms