Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC115Q96NT0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC115Q96NT0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC115Q96NT0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms