Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC17Q96LX7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC17Q96LX7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC17Q96LX7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC17Q96LX7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms