Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB3

IFT74, Intraflagellar transport protein 74 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT74Q96LB3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
IFT74Q96LB3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
IFT74Q96LB3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT74Q96LB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT74Q96LB3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT74Q96LB3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms