Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP47Q96K76 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP47Q96K76 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP47Q96K76 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
USP47Q96K76 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.81■■■■□ 3
USP47Q96K76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
USP47Q96K76 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP47Q96K76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP47Q96K76 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP47Q96K76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP47Q96K76 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USP47Q96K76 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP47Q96K76 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.77■■■■□ 3
USP47Q96K76 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP47Q96K76 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
USP47Q96K76 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
USP47Q96K76 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
USP47Q96K76 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
USP47Q96K76 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.76■■■■□ 3
USP47Q96K76 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
USP47Q96K76 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms